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　　通常，实验学家习惯于用MicrosoftPowerPoint或者PhotoShop等专业图形处理工具绘制蛋白质功能结构域的示意图。然而，功能结构的实际比例很难用眼睛丈量，因此按比例精确地绘制蛋白质功能结构域无法实现。况且，这些工具对于特定序列模体或者功能性位点（例如磷酸化修饰位点）也只能是粗略的标记。因此，制备一张精致的示意图非常耗时费力。此外，虽然有很多能够自动绘制蛋白质功能结构域示意图的计算软件，例如，Pfam[1]，SMART[2]，PROSITE[3]，InterPro[4]和相互数据库或者在线的工具，都可以根据给定的蛋白质序列预测功能结构域的组成，并且直接生成图示。但是这些工具不能帮助实验学家绘制自创的图示。开发能帮助用户绘制蛋白质功能结构域示意图的计算机软件，对于生物实验学家交流他们的研究成果很有必要。

　　物FANCI蛋白质（其中，S556,S730,T952和S1121为磷酸化位点）(5)。其唯一的泛素化修饰位点（K523）以及与其相互作用的FANCD2蛋白对于DNA损伤修复起着重要的作用。R1285的单突变体就可以破坏范可尼贫血症的生物反应途径。这里，我们用DOG1.0重新绘制FANCI蛋白质的结构域/基序/位点的示意图（见图1a），FANCI蛋白质包含了一个酯钙蛋白折叠结构域（612-650），还有一个核定位信号结构域（NLS，779-795，在图1A中隐藏）和ARM重复结构域（985-1207）。图1A展现了单泛素化修饰位点、多个磷酸化修饰位点和致病突变体。TBC1D11/GAPCenA是Rab4的GTP酶激活蛋白质（GAP）[6]。在此，我们重新绘制了功能结构域的细节信息（图1b）。Martindill等发现一个跟HICp40相互作用的新蛋白质Hand1[7]。在干细胞分化途径中，HICp40作为一个分子开关，反向调节Hand1的活性[7]。HICp40的结构域关系如图1c所示。Ou等人在线虫中鉴定出一个新的纤毛蛋白F35D11.11B[8]。我们重新绘制了F35D11.11B的功能结构域示意图（如图1d所示）。总之，DOG1.0能大大的帮助分子细胞实验学家用更精确、便利、简单的方式绘制蛋白质功能结构域示意图。

　　们自己研究的蛋白质功能结构域示意图。简单的四步操作使得DOG1.0软件便于应用。输入功能结构域相对比例和功能性基序/位点的位置参数，提高了其图示的精确性，还可以直接 输出为用于发表的高质量图片，存储为 PNG 或者 JPEG 的文件格式。尽管图中不必要显示 所有的信息，但是蛋白质功能结构的所有参数都能存储为一个 XML 格式的文件中。我们建 议用户将目标文件作为补充材料直接和其手稿一并提交。这样有助于开阔思维，理解蛋白质 的功能结构域，并且有利于进一步的指导生物实验。尽管 DOG 1.0 工具主要是为实验学家 设计的，但是它对于数据库/程序设计师也同样适用。例如，DOG 工具不仅能显示示意图， 还能将蛋白质序列数据和其它相关的信息存入同一个文件，那么这将发展成为第一个用于存 储可视化生物数据的标准文件格式。今后，我们将根据实验学家和数据库/编程设计师的建 议和评论，定时更新 DOG 工具。 DOG 1.0 工具可以从 免费下载。