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RNA结合蛋白 (RBP) 可在转录或转录后水平调控基因表达,是非编码RNA调控、相分离等过程中的重要组成元件,其功能异常与多种人类重大疾病发生发展密切相关,已成为当前生命科学前沿研究热点之一。基于RNA-蛋白互作原理的技术研发也层出不穷,不断推陈出新,引领着分子生物学的发展。哺乳动物睾丸组织是转录组最为复杂、RNA结合蛋白特异性表达最多的器官,而发生是一个极其复杂而独特的细胞分化和发育过程,受到一组时空特异性表达基因的精密调控。然而,由于缺乏合适的生精细胞体外培养体系,同时经典的RNA相互作用组捕获技术难以应用于睾丸提取的原代生精细胞,对于发生中大量RNA结合蛋白如何通过与其靶RNA互作调控RNA命运的分子机制、RNA结合蛋白的突变以何种程度和特点影响男性不育等的了解还极其有限。
这项研究首次以实验和生信手段结合,系统、多维度地探究了哺乳动物生精细胞中RNA结合蛋白的种类、特征和动态规律,揭示了生殖细胞发育中用于RNA结合和调节的新蛋白质功能元件 (尤其是涉及当前新兴的、存在于蛋白非结构域的无序区元件) ,并将这些蛋白及其组成的遗传扰动与人类男性不育全面关联起来,为RNA结合蛋白前沿领域与发生领域的交叉融合提供了独特而新颖的视角。此项研究是一项开创性的工作,为认识和理解动物器官发育过程中RNA结合蛋白的功能机制提供了新方向和新思路。同时,该工作还对多种技术方法学进行了有机组合,综合了生化、分子、细胞、动物、组学、生信等多水平数据 (例如,CLIP-seq与单细胞转录组联合分析) ,并得到了大规模人类临床数据的支撑。这种多方法、多维度的整合研究模式,使我们能够从基于生化实验手段的蛋白质组,发现功能结构域乃至非结构域元件,再深入到与发生和男性不育有关的特定蛋白质及元件的作用机制研究。该工作为基础和临床结合研究复杂发育过程中的RNA结合蛋白提供了重要的数据资源、创新的研究思路和先进的技术方法。