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蛋白质结构域相互作用数据库DDIB,DATABASEOFDOMAININTERACTIONANDBINDING是专门搜集文献记载的关于蛋白质结构域DOMAIN相互作用的数据库。其总体思路是构建一个DOMAIN相互作用关系为主要内容,结合一些预测算法工具和其他数据库交叉整合信息的网络数据库。本文在数据库建设过程中,设计了一套自动对文献中DOMAIN的相互作用关系进行识别提取的系统,并用它来完成对大部分DOMAIN相互作用数据的搜集工作。作为数据库的应用工具之一,用SVM方法构建的蛋白质相互作用预测算法是一个方便高效的预测方法,主要通过用SVM方法对已知的蛋白质相互作用进行训练学习,从而获得预测模型,对未知蛋白质相互作用进行预测。可以通过国际互联网访问DDIB数据库,HTTP//
赏币关键词:生物信息 数据库 蛋白质结构域 信息提取 支持向量机 预测算法资源描述:蛋白质结构域相互作用数据库(DDIB, database of domain interaction and binding)是专门搜集文献记载的关于蛋白质结构域(domain)相互作用的数据库。 其总体思路是构建一个domain相互作用关系为主要内容, 结合一些预测算法工具和其他数据库交叉整合信息的网络数据库。 本文在数据库建设过程中,设计了一套自动对文献中domain的相互作用关系进行识别提取的系统, 并用它来完成对大部分domain相互作用数据的搜集工作。 作为数据库的应用工具之一, 用SVM方法构建的蛋白质相互作用预测算法是一个方便高效的预测方法, 主要通过用SVM方法对已知的蛋白质相互作用进行训练学习,从而获得预测模型,对未知蛋白质相互作用进行预测。 可以通过国际互联网访问DDIB数据库, 展开阅读全文众赏文库所有资源均是用户自行上传分享,仅供网友学习交流,未经上传用户书面授权,请勿作他用。关于本文本文标题:蛋白质结构域相互作用数据库及其相关工具的建立.pdf