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　　第三十一页，共58页。 三. ?-转角 (?-turn) 第三十二页，共58页。 第三十三页，共58页。 ? -turn 第三十四页，共58页。 第三十五页，共58页。 ?- 凸起（?-Bulge） 第三十六页，共58页。 氨基酸在二级结构中出现的几率： 第三十七页，共58页。 第三十八页，共58页。 没有一定规律的松散肽链结构。 酶的活性部位。 四. 无规卷曲 第三十九页，共58页。 是支架和外保护， 占脊椎动物体内蛋白质总量的一半或一半以上。 包括：（1）不溶性（硬蛋白，如：角蛋 白、胶原蛋白、弹性蛋白）； （2）可溶性（如：肌球蛋白、纤 维蛋白原）。 第五节 纤维状蛋白质 （Fibrous proteins） 第四十页，共58页。 第四十一页，共58页。 一. 角蛋白：α—角蛋白和β—角蛋白 (1) α-角蛋白（α-Keratin） (2) β-角蛋白（β-Keratin） 二. 胶原蛋白（Collagen） 三. 弹性蛋白 第四十二页，共58页。 一. 角蛋白： (1) α-角蛋白（α-Keratin） 右手α- 螺旋 原纤维（左旋的三股α- 螺旋，直径2nm） 微原纤维（直径8nm） 大原纤维（直径200nm） 第四十三页，共58页。 硬角蛋白——含硫量高（二硫键多），如：蹄、爪、角、甲 软角蛋白——含硫量低（二硫键少），如：皮肤 第四十四页，共58页。 (2) β-角蛋白（β-Keratin） 第四十五页，共58页。 第四十六页，共58页。 第四十七页，共58页。 silk fibroin 第四十八页，共58页。 蛋白质的三维结构 第一页，共58页。 第一节 研究蛋白质构象的方法 第二节 稳定蛋白质三维结构的作用力 第三节 多肽主链折叠的空间限制 第四节 二级结构的基本类型 第五节 纤维状蛋白质 第六节 超二级结构和结构域 第七节 球状蛋白质与三级结构 第八节 膜蛋白的结构 第九节 蛋白质折叠 第十节 亚基缔合和四级结构 第二页，共58页。 第一节 研究蛋白质构象的方法 一. X射线衍射法 二．研究溶液中蛋白质构象的光谱学方法 1．紫外差光谱： 2. 荧光和荧光偏振： 3. 圆二色性： 4. 核磁共振（NMR）： 第三页，共58页。 X-Ray Diffraction 第四页，共58页。 Two-dimensional NMR 第五页，共58页。 共价键 次级键 化学键 肽键 一级结构 氢键 二硫键 二、三、四级结构 疏水键 盐键 范德华力 三、四级结构 第二节 稳定蛋白质三维结构的作用力 第六页，共58页。 第七页，共58页。 第三节 多肽主链折叠的空间限制 酰胺平面（肽平面） α-碳原子的二面角（φ和

　　） 三. 拉氏构象图(Ramachandran plot ) 第八页，共58页。 第九页，共58页。 第十页，共58页。 第十一页，共58页。 Most of combination of f and y are sterically forbidden. 第十二页，共58页。 G. N. Ramachandran and his coworkers in Madras, India, first showed that it was convenient to plot to show the distribution of allowed values in a protein or in a family of proteins. A typical Ramachandran plot is shown in this figure. 第十三页，共58页。 第十四页，共58页。 多肽链在一级结构的基础上，按照一定的方式有规律的旋转或折叠形成的空间构象。 α-螺旋、β-折叠、 β-转角、无规卷曲 第四节 二级结构的基本类型 第十五页，共58页。 一. ?-螺旋（ ?-helix ） 第十六页，共58页。 螺旋上升一周包含3.6个氨基酸残基；每个残基沿轴旋转100。；每两个残基之间的距离为0.15nm；螺距0.54nm; ?-螺旋中氨基酸残基侧链伸向外侧，相邻的螺圈之间形成氢键（每个氨基酸残基的N-H都与前面第四个残基C=O形成氢键），氢键的取向几乎与轴平行。 ?-螺旋有左手螺旋和右手螺旋两种。天然蛋白质的?-螺旋多为右手螺旋。 ?-螺旋的结构要点： 第十七页，共58页。 第十八页，共58页。 ?-螺旋：偶极矩帽化 第十九页，共58页。 氨基端 羧基端 ?-螺旋的手性 右手的比左手的更稳定 ?-螺旋具有旋光能力 形成具有协同性 第二十页，共58页。 影响蛋白质?-螺旋结构稳定的因素 2.R基的大小 1.相同电荷的氨基酸 Pro Gly 第二十一页，共58页。 ?-螺旋的类型:3.613—螺旋；310—螺旋；π螺旋（4.416—螺旋） 第二十二页，共58页。 二. β-折叠结构 (β-sheet) 第二十三页，共58页。 多肽链呈锯齿状（或扇面状）排列成比较伸展的结构； 侧链R基团交替地分布在片层平面的上下方，片层间有氢键相连； 有平行式和反平行式两种。 β-折叠结构要点： 第二十四页，共58页。 第二十五页，共58页。 N端 C端 第二十六页，共58页。 N端 C端 N端 C端 第二十七页，共58页。 第二十八页，共58页。 第二十九页，共58页。 第三十页，共58页。