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　　1、复旦大学生物化学系,黄伟达,蛋白质的二级结构,复旦大学生物化学系,黄伟达,作用力 破坏因子 氢键： -螺旋，-折叠 尿素，盐酸胍 疏水作用： 形成球蛋白的核心 去垢剂，有机溶剂 Van der Waals力：稳定紧密堆积的集团和原子 离子键：稳定-螺旋，三、四级结构 酸、碱 二硫键：稳定三、四级结构 还原剂 配位键：与金属离子的结合 螯合剂 EDTA,维持蛋白质空间构象的作用力,H2NC(:NH)NH2 HCl,维持空间构象的作用力,复旦大学生物化学系,黄伟达,蛋白质结构的层次,一级结构：氨基酸序列 二级结构：螺旋，折叠 超二级结构 Module 结构域（domain） 三级结构：所有原子空间位置 四级结构：蛋白质多聚体,蛋白质的结构层次,复旦大学生物化学系,黄伟达,肽键的特征,复旦大学生物化学系,黄伟达,肽键平面,肽键平面,复旦大学生物化学系,黄伟达,肽链中的肽平面,肽链中的肽平面,复旦大学生物化学系,黄伟达,两个肽平面以一个C为中心发生旋转,两面角,复旦大学生物化学系,黄伟达,Ramachandran Plot,Ramachandran Plot,复旦大学生物化学系,黄伟达,蛋白质

　　3、周期，螺距0.54 nm,第n个AA(NH)与第n-4个 AA(CO)形成氢键，环内原子数13。,螺旋的特性,复旦大学生物化学系,黄伟达,左旋和右旋的判断,左旋和右旋的判断,复旦大学生物化学系,黄伟达,Pauling预测的三种螺旋结构,3.010 helix,16 helix, helix,Pauling预测的三种螺旋,第 X 个氨基酸的氨基与（Xn）个氨基酸的羧基之间形成氢键,环内原子数N3n+1,复旦大学生物化学系,黄伟达,角蛋白keratin的结构特征,Keratin的结构特征,复旦大学生物化学系,黄伟达,胶原蛋白Collagen的特殊性,Collagen的结构特征,复旦大学生物化学系,黄伟达,Collagen的结构特征2,左旋的肽链,截面图,复旦大学生物化学系,黄伟达,结缔组织中的胶原蛋白,组织中的胶原蛋白,复旦大学生物化学系,黄伟达,反平行折叠,反平行折叠,复旦大学生物化学系,黄伟达,平行折叠,平行折叠,复旦大学生物化学系,黄伟达,折叠的侧链位置,复旦大学生物化学系,黄伟达,转角相当于半圈3.010 螺旋,转角,复旦大学生物化学系,黄伟达,20种氨基酸在二级结构中出现的频率,复旦大学生物化学系,黄伟达,二级结构的基本参数,