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Dogecoin - An open-source peer-to-er digital currencyNat Cell Bio万刚团队揭示多相凝聚体结构的不混容性调节小RNA驱动的跨代表观遗传的机制

作者:小编2024-12-20 17:53:09

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Dogecoin - An open-source peer-to-peer digital currencyNat Cell Biol 万刚团队揭示多相凝聚体结构的不混容性调节小RNA驱动的跨代表观遗传的机制

  生殖颗粒是位于几乎所有后生动物生殖细胞核周的凝聚体,通过富集小RNA信号通路蛋白调控生殖细胞中RNA的命运和生殖细胞的正常发育。在秀丽隐杆线虫 (C. elegans) 中,生殖颗粒位于生殖细胞细胞核的核孔上面,并至少由四个空间上邻近且有序的凝聚体组成多相凝聚体 (P颗粒、Z颗粒、M小体、S小体) 。不同的凝聚体富集不同但功能上相关的小RNA信号通路,如P颗粒富集线虫的piRNA相关蛋白、Z颗粒富集小RNA介导的跨代表观遗传相关蛋白、M小体富集小RNA扩增相关蛋白等。这些多相凝聚体被认为促进和协调复杂的RNA调控网络,异常的凝聚体结构通常导致RNA调控网络的紊乱、生殖细胞永生化的破坏和绝育。然而生殖颗粒的多相凝聚体形成的机制和协调小RNA信号通路并调控生殖细胞功能的机制还很不清楚。

  该研究首先通过优化的TurboID介导的生物素邻近标记技术,时空特异性地标记秀丽线虫生殖颗粒中不同凝聚体的蛋白并进行蛋白质谱分析,发现了大量未被报道的可能的不同凝聚体特异蛋白。生物信息分析表明不同凝聚体富集不同的蛋白质结构域和不同氨基酸基序的固有无序结构,提示这些结构域可以介导不同凝聚体的组装或者功能。通过功能筛选未被报道的编码PZM凝聚体组分的基因,发现了11个影响生殖细胞永生性和RNAi的基因,该功能筛选发现了一个同时参与这两个过程的新蛋白,HERD-1。令人意外的是,在HERD-1突变的线虫中,虽然生殖系RNAi介导的基因沉默缺陷,RNAi跨代表观遗传却增强到50代以上,同时观察到突变体中生殖颗粒的多相凝聚体结构被破坏而融合。结合亲和质谱和免疫共沉淀实验发现HERD-1可能通过降低或者阻止Z颗粒的蛋白网络与相邻两个生殖颗粒的支架蛋白 (GLH-1和MUT-16) 之间的相互作用,促进多相结构的形成。

  中山大学生命科学学院万刚教授该研究通讯作者,博士生研究生赵长丰和蔡时煜为论文共同第一作者。该研究得到了国家自然科学基金面上项目,广东省自然科学基金面上项目和深圳市医学专项的资助。万刚教授课题组长期致力于研究非编码RNA、RNA结合蛋白和RNA granules的形成、功能和作用机制,代表性工作发表在Nature (2018), Nature Cell Biology (2024), EMBO Journal (2024, 2021), Autophagy (2014a, 2014b), Genetics (2020)等期刊。万刚教授课题组长期欢迎博士后、博士研究生和硕士研究生等有志于科研的人才的加入,有意者请将简历等材料发送至